مرکز آموزشی و درمانی نیکوکاری پس از استقلال و منفک شدن گروه چشم از مرکز آموزشی و درمانی امام خمینی در سال تحصیلی 1363-1364 و استقرار آن در محل فعلی بیمارستان نیکوکاری که سابقا بیمارستان و زایشگاه خیریه نیکوکاری نامیده می‌شد مستقر گردید.
پس از استقرار گروه چشم کتابخانه آن نیز آغاز به کار نموده و از آن به بعد هر ساله در زمان نمایشگاه بین المللی کتاب که تقریبا اوایل اردیبهشت هر سال برگزار می‌گردد جدیدترین کتابهای موضوعی چشم خریداری میشود.
کلیه اعضای محترم هیات علمی گروه چشم پزشکی، دستیاران تخصصی و فوق تخصصی و کارکنان بیمارستان از اعضاء کتابخانه می‌باشند و براحتی می توانند نیازهای علمی خود را از این طریق مرتفع نمایند.
کتابخانه دارای ارتباط اینترنت می‌باشد و مراجعین می‌توانند نیازهای علمی خود را از طریق آن برآورده کنند. همچنین جدیدترین یافته‌های علمی در زمینه چشم که معمولا در مجلات به چاپ می‌رسند از طریق پایگاه e-journal کتابخانه مرکزی در دسترس کاربران قرار می‌گیرد.
کتابخانه روزانه از ساعت هفت و نیم تا ساعت پانزده جهت استفاده کاربران اعم از اساتید، کارکنان مرکز، دانشجویان پزشکی عمومی، دانشجویان تخصصی و فوق تخصصی چشم ارائه خدمات می‌دهد.
کتابخانه به مجموعه سازی، سازماندهی و اشاعه اطلاعات در راستای اهداف و فعالیت های مرکز اهتمام جدی دارد. کتابخانه در راستای همگام نمودن منابع و خدمات مرکز با تحولات جامعه و نیازهای متحول جامعه کوشش می‌کند.
کتابخانه سعی در فراهم ساختن امکان دسترسی سریع و راحت به منابع اطلاعاتی برای اعضای هیات علمی، دانشجویان و کارکنان مرکز به منظور پشتیبانی از هدف‌های آموزشی و پژوهشی کنونی و آینده مرکز را در سرلوحه اهداف و عملکرد خود دارد.
کتابخانه مرکز چالش برای افزایش بودجه مورد نیاز خرید منابع برای فعالیت‌های آموزشی و پژوهشی اعضای هیات علمی، پژوهشگران و دانشجویان را دارد. کتابخانه مرکز در جستجوی تامین و تقویت مناسب‌ترین منابع علمی در حوزه های آموزشی و پژوهشی مورد نیاز مرکز می‌باشد.
کتابخانه مرکز برای تامین و تجهیز فضای مناسب جهت نگهداری منابع و تجهیزات و نیز بهره گیری بیشتر اعضا از کتابخانه مرکز تلاش می‌کند.