همزمان با استقلال و منفک شدن گروه چشم از مرکز آموزشی و درمانی امام خمینی در سال تحصیلی 1364-1363 این گروه (گروه چشم) در محل فعلی بیمارستان نیکوکاری که سابقا بیمارستان و زایشگاه خیریه نیکوکاری نامیده می‌شد مستقر گردید و به مرکز آموزشی و درمانی چشم نیکوکاری تغییر نام یافت. پس از استقرار گروه چشم در این مرکز کتابخانه آن نیز آغاز به کار نموده و از آن به بعد هر ساله در زمان نمایشگاه بین المللی کتاب (تقریبا اوایل اردیبهشت هر سال) جدیدترین کتابهای موضوعی چشم خریداری می‌گردد.

کلیه اعضای محترم هیات علمی گروه چشم پزشکی، دستیاران تخصصی و فوق تخصصی و کارکنان بیمارستان از اعضاء کتابخانه می‌باشند و براحتی می‎توانند نیازهای علمی خود را از این طریق مرتفع نمایند. کتابخانه شامل 6 دستگاه کامپیوتر می باشد که در دسترس کاربران مرکز است و نرم‌افزاری که در کتابخانه مورد استفاده کاربران قرار می گیرد تحت عنوان azarsam می‌باشد.

کتابخانه بیمارستان نیکوکاری دارای خط اینترنت بوده و مراجعین می‌توانند نیازهای علمی خود را از طریق اینترنت برآورده کنند. همچنین جدید ترین یافته های علمی در زمینه چشم که معمولا در مجلات به چاپ می‌رسند از طریق پایگاه e-jornal کتابخانه مرکزی در دسترس کاربران قرار می‌گیرد. کل فضای کتابخانه (مخزن، سالن مطالعه و...) 103.144 مترمربع می‌باشد. کتابخانه روزانه از ساعت 15-7.5 به ارائه خدمات به کاربران اعم از اساتید، کارکنان مرکز، دانشجویان پزشکان عمومی، دانشجویان تخصصی و فوق تخصصی چشم ارائه خدمات می‌نماید.